تیمور پس از لشکرکشی به هندوستان تصمیم گرفت مسجدی را به یاد همسرش در سمرقند بسازد. ورودی اصلی این بنا با ارتفاع ۳۵ متر یکی از جذاب‌ترین جاذبه‌هایی است که در سفر به ازبکستان می‌توانید مشاهده کنید. درون این مسجد، قرآن بزرگی از جنس مرمر قرار دارد که زیبایی خاصی به آن بخشیده است.

این مسجد در مدت ۵ سال توسط معماران ماهر ایرانی و هندی ساخته شد. اما تیمور از پیشرفت ساخت آن راضی نبود و پس از اتمام بنا، به سرعت تغییرات متعددی، به ویژه در گنبد اصلی، اعمال کرد. ارتفاع این گنبد به ۴۰ متر می‌رسد. مسجد بی‌بی‌خانم هر ساله گردشگران زیادی را به میدان ریگستان جذب می‌کند و یکی از جاذبه‌های دیدنی این شهر تاریخی به شمار می‌آید.